Družina Darling ima tri vremenske otroke. Najstarejša je Wendy, nato pride John, nato pa Michael. Imajo nenavadno varuško - velikega črnega potapljaškega psa po imenu Nena. Nekega večera, ko gre v spalnico z otroki, ki so že v postelji, gospa Darling zagleda fanta, ki leti v okno, za njim pa čudno svetleče mesto. Presenečeno zakriči, Nan teče, da kriči. Fant uspe odleteti skozi okno, toda v Neinih zobeh ostane njegova senca! Gospa Darling jo zvadi in položi v skrinjo.
Nekaj dni kasneje bosta gospa in gospod Darling na obisku. G. Darling v naglici trči v Neno in na hlačah - to je težava! - plašč ostane. Gospod Darling brca Nano na dvorišče in jo postavi na verigo. Takoj, ko starši zapustijo hišo, otrokom prileti majhna luč - to je vila Tinker Bell, išče senco. Za njo se pojavi Peter Pan. Z znakom Tinker Bell (vila ne zna govoriti, naredi melodičen zvonjenje) Peter najde senco in jo poskuša prilepiti nazaj, a nič ne pride ven. Peter začne jokati in njegovi strehovi zbudijo Wendy. Potem ko je izvedela, kaj se dogaja, Wendy prišije senco Petrovim petam. Malo ga boli, a trpi. Čuti zaupanje v Wendy, Peter ji pove o sebi: pobegnil je od doma in se odločil, da nikoli ne bo postal odrasel.Živi na otoku Netinebud z izgubljenimi fanti ("ko otrok pade iz vozička, gre v državo Netinebud"). Obenem se vile nekaj izkažejo: izkaže se, da se vile rodijo iz otroškega smeha in vsak otrok ima svojo vilino. Toda takoj, ko nekdo pomisli "neumno, vile ni na svetu" - in vila umre.
Ko izve, da Wendy zna pripovedovati pravljice, Peter pokliče Wendy na otok ("Naučil te bom leteti in skupaj bomo leteli"), da bo pripovedovala pravljice in je mati vseh izgubljenih fantov. Wendy okleva, vendar se vseeno strinja. John in Michael letita z njo.
Prebivalci otoka se pripravljajo na srečanje s Petrom. Fantje iščejo kraj, kjer pristane Peter. Pirati, ki jih vodi kapitan Jez Hook, iščejo fante, rdeče kože (njihov vodja je Veliki mali panter) iščejo gusarje, divje živali pa iščejo rdeče kože, da bi jih pojedle.
V pričakovanju prihoda Wendy se pojavi pravljični Tinker Bell. Ona (iz ljubosumja!) V imenu Petra ukaže fantom, da ustrelijo Wendy z lokom. Nimajo razloga za dvom in eden od njih ustreli. Wendy pade na tla in leži mrtva. A ni umrla, rešil jo je želod, ki mu visi okoli vratu, darilo Petra Pana in strela ga je prebila puščica. Toda Wendy je zelo šibka in vsi fantje, pod vodstvom bližajočega se Petra, ji zgradijo hišo in jo postavijo tik okoli nje. Hiša se izkaže precej dobro. Wendy se resno ukvarja s svojimi nalogami: kuha, briše, daruje in, seveda, pripoveduje pravljice.
Pirati fantje ne pustijo pri miru. Kapetan Kuka - njegovo ime je odkar mu je Peter odrezal roko, namesto katerega je moral popraviti železni kavelj - Peter tega ne more odpustiti, še posebej, ker je krokodil roko tako pogoltnil, da mu je bilo tako všeč, da lovi Kuko Dobro je, da to slišite s kvačkanjem kapetanove ročne ure, ki ni nehala hoditi po trebuhu krokodila. Kapetan pride na idejo, da bi zastrupljeno torto spekel, da bi fantje umrli, a na tak način ne uspe doseči ničesar - Wendy jim ne dovoli jesti sladkarij, torta pa varno ostane na travniku, dokler se kapitan ne spotakne nad njo v temi in pade na tla. Nekega dne želijo gusarji indijsko princeso Tiger Lily privezati na skalo v laguni, da jo preplavi z plimo. Peter Pan uspe prevarati gusarje tako, da jim (na glas stotnika Kuka) naroči, naj jo izpustijo. Potem se mora Peter boriti s Kukom in ga rani. Peter reši ptico.
Nekega večera Wendy fantom pove svojo najljubšo pravljico - kako sta živela en gospod in ena dama, kamor so otroci nekega dne odleteli na otok Netinebud. In kako so vedno držali okno odprto, da so otroci lahko poleteli domov.
Peter nasprotuje Wendy: že prej je razmišljal o takih materah, zato se mu ni mudilo vrniti. In ko je prispel, se je okno zaprlo in v postelji je spal še en fant.
Potem John in Michael, brata Wendy, spoznata, da morata pohiteti domov.Wendy pokliče tudi z ostalimi fanti, prepričana, da jih bodo njeni starši zagotovo posvojili. Vsi se strinjajo, razen Petra Pana, ki noče postati velik. Peter prosi Indijance, naj vidijo Wendy in fante, vendar gusarji spet posredujejo. Indijcem uspejo na nepošten način premagati Indijce in ujeti Wendy in fante. Peter izve za to od Tinker Bell in hiti na pomoč. Odločilna je bitka med Petrom Panom in stotnikom Kukom. Gusarji so poraženi. Fantje in Wendy letijo domov.
Medtem v Londonu gospa in gospod Darling še naprej čakata na otroke in nikoli ne zapirajo oken vrtca. In gospod Darling si ne more odpustiti, ker je tistega groznega večera Nanu brcnil ven iz hiše in jo dal na verigo. Zato se je zaobljubil, dokler se otroci niso vrnili živeti v pasjo hišo, ga odpeljali na delo in ga pripeljali domov iz službe. Gospa Darling sedi za klavirjem in začne igrati. V tem času prideta Peter in Tinker Bell. Zaprejo okno, tako da se Wendy odloči, da ga mama ne bo več čakala in je ne ljubi, in bi se s Petrom vrnila na otok. Toda v zvoku glasbe je velika žalost in Peter spet odpre okno. Wendy, John in Michael letijo skozi okno in se povzpnejo v svoje postelje. Mati jih odkrije, pokliče očeta, v sobo pa tudi teče Nana. Vsi so veseli. In fantje čakajo spodaj, medtem ko Wendy o njih pripoveduje svojim staršem. Ko so prešteli pet tisoč, vstopijo v hišo in se postavijo pred gospo Darling. Seveda sta se gospa in gospod Darling odločila, da ju bosta posvojila! Peter spet odleti na otok. Wendy obljubi, da bo letela prihodnje leto, a na to pozabi.In ko se Peter ponovno pojavi, je Wendy že poročena in ima malo hčerko Jane.
Ne opazi sprememb, Peter pokliče Wendy z njim, vendar ona odkloni s vzdihom, ker je že odrasla. Wendy zapusti sobo, da se umiri, Peter Pan pa sedi na tleh in joka. Njegovi tremaji zbudijo Jane.
In spet se vse ponovi.
Ko Jane odraste, se rodi njena hči Margaret in zdaj Margaret leti s Petrom Panom na otok Netinebud ... In to bo še naprej, dokler otroci ne bodo prenehali biti tako veseli, nerazumljivi in brezsrčni.
